A DNS szintézis hatékonyságát meghatározó tényezők

A tipikus DNS, RNS és nem természetes nukleinsavak szintézisében a védőcsoport eltávolítása és kapcsolási lépése döntő szerepet játszik.

A védőcsoport eltávolítása a szilárd hordozón lévő DMT-csoport vagy az előző nukleozid 5'-hidroxilcsoportjának szerves savval történő eltávolítása, és a hidroxilcsoport feltárása a következő kapcsolási lépéshez.A védőcsoport-eltávolítási lépés végrehajtásához többnyire a 3%-os triklór-ecetsavat diklór-metánban vagy toluolban használják.A végtermékek tisztaságát a triklór-ecetsav koncentrációja és a védőcsoport eltávolítási ideje (deblokkolási idő) határozza meg.Az alacsony koncentráció és az elégtelen deblocking idő nem reagált a DMT csoportra, ami csökkenti a hozamot és növeli a nem kívánt szennyeződéseket.A hosszan tartó deblocking idő a szintetizált szekvenciák depurinjához vezethet, és váratlan szennyeződéseket képezhet.

A kapcsolási lépés érzékeny az oldószerek víztartalmára és a levegő nedvességére.A szintézisben a víz koncentrációja kevesebb, mint 40 ppm, jobb, ha kevesebb, mint 25 ppm.A vízmentes szintézis állapotának megőrzése érdekében a nukleinsavak szintézisét alacsony páratartalmú környezetben kell elvégezni, ezért javasoljuk ügyfelünknek aAmidites oldott berendezések, amely fel tudja oldani a por alakú vagy olajos foszforamiditot vízmentes acetonitrilben, hogy elkerülje a levegővel való érintkezést.

A DNS szintézis hatékonyságát meghatározó tényezők5
A DNS szintézis hatékonyságát meghatározó tényezők4

Mivel a foszforamiditek oldása jobb a nem víz helyzetben, és a molekuláris csapdák adszorbeálják a reagensekben és az amiditben lévő nyomvizet, ezért elő kell készíteni aMolekuláris csapdák.50-250 ml-es reagenspalackokhoz 2 g-os, 250-500 ml-es reagenspalackokhoz 5 g-os, 500-1000 ml-es reagenspalackokhoz 10 g-os, 1000-2000 ml-es reagenspalackokhoz 20 g-os szitát ajánlunk.

A foszforamiditek feloldását inert atmoszférában kell elvégezni, az aktivátor reagensek és az acetonitril cseréjét időben be kell fejezni.A kupakoló és oxidáló reagenseket a lehető leghamarabb fel kell használni, a felbontott reagensek rövidebb eltarthatósági időt és kisebb aktivitást biztosítanak a szintézis során.


Feladás időpontja: 2022-09-09